mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACACTGTCTGGTAACGATGT ATCTTACCGGACAGTGCTGGA CCGGGCCCCTGTGAGCATCTTACCGGACAGTGCTGGATTTCCCAGCTTGACTCTAACACTGTCTGGTAACGATGTTCAAAGGTGACCCAC 4 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-8 1e-28 hsa-mir-200a 7e-45 -46.4 ..((((.(((.(((((((((((((((((((((((((.....)))))...........)))))))))))).)))))))).))).).))).. (-46.40)