mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAAATGTTTAGGACCACTAG AGTGGTTCTTAACAGTTCAACAG GTGCTGGGGACTCGCGCGCTGGGTCCAGTGGTTCTTAACAGTTCAACAGTTCTGTAGCGCAATTGTGAAATGTTTAGGACCACTAGACCCGGCGGGCACGGCGACAGCGA 3 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-203 1e-31 ppy-mir-203 2e-55 -55.6 .(((((..(....((.(((((((((.(((((((((.((((.((((.((((((......).))))))))).)))).))))))))).))))))))).))....)..))))). (-55.60)