mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCTTTGTCATCCTATGCCT GCTGGGAAGGCAAAGGGACGT GGCTACAGTCTTTCTTCATGTGACTCGTGGACTTCCCTTTGTCATCCTATGCCTGAGAATATATGAAGGAGGCTGGGAAGGCAAAGGGACGTTCAATTGTCATCACTGGC 2 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-204 2e-42 sla-mir-204 6e-58 -42.26 (((....))).....(((((((((...(((((.((((((((((.(((((.((((...............))))))))).)))))))))).)))))...)))).)).))). (-42.26)