mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AGTTGAGTCTGGACGTCCCG CCGCCCCGGGCCGCGGCTCCTGATTGTCCAAACGCAATTCTCGAGTCTATGGCTCTGGCCGAGAGTTGAGTCTGGACGTCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCTCGAGGGGG 3 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-219 8e-27 ggo-mir-219 4e-53 -56.9 ...((((((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))). (-56.90)