mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AATTGTGGCTGGACATCTGT ACTCAGGGGCTTCGCCACTGATTGTCCAAACGCAATTCTTGTACGAGTCTGCGGCCAACCGAGAATTGTGGCTGGACATCTGTGGCTGAGCTCCGGG 3 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-219 1e-34 eca-mir-219-2 3e-50 -49.9 .(((.(((((((.(((((.(((.(((((..(((((((((((...(.((.....)))...)))))))))))..)))))))).))))).)))))))))) (-49.90)