mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTTCCATAATAT ATTATGGGACGGAGAGGTAG CATTGTGAACTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGATGGTTTTGCAAGCAGTTTTAGCTTATATTATGGGACGGAGAGGTAGTATATTGC GGCACGAGGTGCACCCGATGTACGAGGAGTCCCTCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCAGCCGGGCCTCGGCCATGGAGGTTGATGGAGGAAGCAAGAAGTCTGCATCCTTCCTGAAGCCAATGGGCACCATTAGCAAGAAGAAGGTACAGCTTCACTTGAAGATCAAGAAAGACAAGAGAAAAGCTAGGAAGAAGGGAAATTCTGGGAAGAAGAGTTATTAGGTGTGCGAGCTGCTCTGTTATGTATCATGCAATTTTGTTTCGTTAGTTTGAACAACATATGTAACGGTAATTCTGCTTGTGAACGTAAGTGTTAACCATCCATTCTAGGGTGGCCAACAATGGAGTACTGAAAAGTATCTCAATGAGCACCCAAACAAAAATAGTGTCGCCGTCTTCGTCTGTTTGTTCCCACTTGCCTTGACTTGAGCTGGCCCGATCACGAGGTTATGCCATTGTGAACTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGATGGTTTTGCAAGCAGTTTTAGCTTATATTATGGGACGGAGAGGTAGTATATTGCAATTGTTAATGCA 1 1 5' arm Triticum_monococcum mirnest MIR1122 0.0000003 tae-MIR1120 0.00002 -34.1 ....(((.((((((..(((((((((((((((((((.(((..(((....)))..))).))))))))))))))))))).)))))).)))... (-34.1)