mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTGGGGGCAGATGT ACCGCAGGGAAAATGAGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTCCATTCCACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCA 4 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-365 1e-40 cfa-mir-365-1 3e-44 -35.4 ...((((((..((((((((..(((((((((((((((((.........))).)))....))))))))))).))))))))..)))))). (-35.40)