mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCACACAAAGGCAACTTTTGT AGAGGTTGCCCTTGGTGAATTC TTGAGCAGAGGTTGCCCTTGGTGAATTCGCTTTATTTATGTTGAATCACACAAAGGCAACTTTTGTTTG 1 2 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-154 8e-32 cfa-mir-377 1e-33 -27.8 ..((((((((((((((.(((((((.(((((.........).)))))))).))).)))))))))))))). (-27.80)