mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGGTATGTCTGTGGGTAGA TACTGCAGGCAGTGGCAATTATG CATGTTGTGTGTGGTACCCTACTGCAGGCAGTGGCAATTATGTATAGTTAAAAATGATTGGTATGTCTGTGGGTAGAGTAATGCATGACACATG 4 2 3' arm Macaca_mulatta mirbase 100 mml-mir-509-2 3e-41 -30.8 (((((.((((((..(((.((((..((((((.((.(((((((.((....))...))))))).))))))))..).))).)))..)))).))))))) (-30.80)