mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGGGAGGTGTCATTTAT AAATTTCACCTTTCTGAGAAGA TGTACAGTGCCTTTCACAGGGAGGTGTCATTTATGTGAACTAAAATATAAATTTCACCTTTCTGAGAAGAGTAATGTACA 5 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase 100 ptr-mir-513a-2 9e-38 -33.5 .(((((.(((.((((.(((..(((((..((((((((........))))))))..)))))..))).)))).))).))))). (-33.50)