mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTTCCTTCCCGAGGGT CGTCTCGAGGAAAGAAGCACT TCTCAGGCTGTGACCGTCTCGAGGAAAGAAGCACTTTCTGTTGTCTAAAGAAAAGGAAGTGTTTCCTTCCCGAGGGTTACGGTTTGAGA 1 3 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-515 3e-44 mml-mir-516a-1 2e-45 -49.6 (((((((((((((((..((((.((((.((((((((((((....((....))..)))))))))))).))))))))))))))))))))))) (-49.60)