mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCGTGCATCCTTTTAGAGTGT CCTCTAGATGGAAGCACTGTCT CTCATGCAGTGACCCTCTAGATGGAAGCACTGTCTGTGGTCTAAAAGAAAAGATCGTGCATCCTTTTAGAGTGTTACCGTTTGAGA 4 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-515 9e-26 hsa-mir-517a 9e-32 -36.4 ((((.((.(((((.(((((((.(((.((((.((((....((.....))..)))).)))).))).))))))).))))).)).)))). (-36.40)