mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGCGCTTCCCTTCAGAGGA CTCTAGAGGGAAGCACTTTAT TCTCAGGCTGTGACCCTCTAGAGGGAAGCACTTTATCTTGTGTGAAAGGAAAGAAAGCGCTTCCCTTCAGAGGATTACTCTTTGAGA 4 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-515 5e-43 ppy-mir-518e 5e-30 -41.4 (((((((..((((.(((((..((((((((.((((.((((.......))))...)))).))))))))..))))).))))..))))))) (-41.40)