mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTGCTTCCCTTTGGACTGT CCTCCAGAGGGAAGTATTTTCT CTCAGGCTGTGACCCTCCAGAGGGAAGTATTTTCTGTTGTCTGAAGGAAAAGAAAGTGCTTCCCTTTGGACTGTTTCGGTTTGAG 2 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-515 7e-42 hsa-mir-520a 6e-36 -46.3 (((((((((.(((..((((((((((((((((((((....((.....))..))))))))))))))))))))..))).))))))))) (-46.30)