mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCAGAGGGATGCACTTTCT AAGGCGCATCCCTTTGGAGCG CTCAGGCTGTGACTCTCCAGAGGGATGCACTTTCTTTTATGTGAAAAAAAAAGAAGGCGCATCCCTTTGGAGCGTTACGGTTTGGG 1 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-515 2e-26 ppy-mir-525 8e-23 -54.5 (((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((.(......).))))))))).)))))))))))))).))))))))))))) (-54.50)