mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGCAAACATTTATTGTGTGC CTCAGTAAATGTTTATTAGATG CCCAGCCTGGCACATTAGTAGGCCTCAGTAAATGTTTATTAGATGAATAAATGAATGACTCATCAGCAAACATTTATTGTGTGCCTGCTAAAGTGAGCTCCACAGG 2 2 3' arm Macaca_mulatta mirbase 100 hsa-mir-545 2e-55 -37.52 .....((((.(((.((((((((((.((((((((((((.((.(((((.............))))))).)))))))))))).).))))))))).))).......)))) (-37.52)