mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACCGGCAATTACTTCTGC AAAAGTAATTGGGGTTTTTTGTC TGTGATGTATTAGGTTGATGCAAAAGTAATTGGGGTTTTTTGTCATTAAAAGTAGTGACAAAACCGGCAATTACTTCTGCACCAAACTAATATAA 2 3 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-548 0.000000000000001 ptr-mir-548a-2 2e-29 -36 .....((((((((.(((.((((.(((((((((.(((((..((((((((....)))))))))))))..))))))))).)))).))).)))))))). (-36.00)