mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACTCCCTCAATCCCAAAAT TTTGAGACGGAAGGAGTAGCA CAGCTGAGGGTGTACTCCCTCAATCCCAAAATAGATGTCGAAGATTTGTCAAAAAATAGATATATCTAGACTTAAATTGTGTCTAGATACATCCTTATTTAGACAAATCTTTGACAACTATTTTGAGACGGAAGGAGTAGCAGGTATCAA ACACGCAGTTCCTGAAGAAAGATGGGCTGAAGGGCAAGAGAATCGGCGTCCCCAATGGCTTCTTCACAGGATACGGGGAGACACAGCTGAGGGTGTACTCCCTCAATCCCAAAATAGATGTCGAAGATTTGTCAAAAAATAGATATATCTAGACTTAAATTGTGTCTAGATACATCCTTATTTAGACAAATCTTTGACAACTATTTTGAGACGGAAGGAGTAGCAGGTATCAAAAAGATCCGCTGGTCTCTATTTCCAGCAACAAAACAAAATTTAGAACAAGTCCTCGATGATAACATCCACTAGCTGCAGGATGACACAAAATTATCTTATCACTTCTTCTCTTCCTTCTCTGCCTCAGCAGCCTTCTTCAGGCGGGCACCAAGCTGGCGCTGGTTCATCCTCTCAACACGGAGTTTGCCGTAAGCCTTGAATGCCTTCATCTCGTCGGTGACCTTCACAACCTCGACCGAGCGCTTCTCACCACGGGTAATTGGCATGTAGTCACCCTGGACCTGG 5 0 5' arm Agrostis_stolonifera mirnest MIR1122 0.0000000001 tae-MIR1122 0.0005 -53.9 ..(((....((.((((((.((..((.((((((((.(((((((((((((((...((((((((.(((((((((.(.....).))))))))).)))..))))).))))))))))))))).)))))))).))..)).)))))))).)))..... (-53.9)