mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGCTCATCCATAGTTGTCA ACAATTATGGATGAGCTCTTA AGACATGCAACTCAAGAATATATTGAGAGCTCATCCATAGTTGTCACTGTCTCAGATCATGACAATTATGGATGAGCTCTTAATATATCCCAGGC 0 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-549 9e-48 ppy-mir-549 2e-42 -44.5 .................(((((((((((((((((((((((((((((..(((...)))..)))))))))))))))))))))))))))))....... (-44.50)