mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGCCTGAGGGAGTAAGAGCCC GTCCTACTCCCTCAGGCACATC TGATGCTTTGCTGGCTGGTGCAGTGCCTGAGGGAGTAAGAGCCCTGTTGTTGTAAGATAGTGTCCTACTCCCTCAGGCACATCTCCAGCAAGT 4 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-550 1e-46 hsa-mir-550a-1 4e-43 -47.4 .........(((.(((((.(..(((((((((((((((.(..(.(((((.......))))).)..))))))))))))))))..).))))).))) (-47.40)