mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTAGCTGTACCATTTGC ATATGGTCAGTCTACTTTCA AGTGAAATTGCTGGGTCATATGGTCAGTCTACTTTCAGAGTAATTGTGAAAGTATTTTTCAAAGTAGCTGTACCATTTGCATTCCCTGTGGCAAT 2 2 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-562 9e-48 hsa-mir-562 4e-37 -27.7 ......(((((((((.((.((((((((.(((((((.((((((.((....)).))))))..)))))))))).))))).))....)))...)))))) (-27.70)