mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCTTGTGCTCTGGGATTGT AATCCTGGACTATAAGAAGCT GATAAATATATAGACAAAATACAATCCTGGACTATAAGAAGCTCCTATAGCTCCTGTAGCTTCTTGTGCTCTGGGATTGTATTTTGTTTATATAT 3 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-578 9e-48 hsa-mir-578 4e-37 -47.1 .....((((((((((((((((((((((..((.(((((((((((...((((...))))))))))))))).))..)))))))))))))))))))))) (-47.10)