mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCTCTGCTGGGGTTTCT CCCCCAGAGTGTGTCAGGCATCAGCCAGGCATCGCTCAGCCCCTTTCCCTCTGGGGGAGCAAGGAGTGGTGCTGGGTTTGTCTCTGCTGGGGTTTCTCCT 5 7 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-593 9e-51 ppy-mir-593 3e-47 -44.8 .((((((((......(((((..((((.((((((((((.(((((((.......))))).))...)))))))))).))))))))))).))))))........ (-44.80)