mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACACACTGCAATTACTTTTTC AAAAGTAATTGTGGTGCTTGCC GATTGATGCTGTTGGTTTGGTCCAAAAGTAATTGTGGTGCTTGCCGTTTATAAGTAATGGCACACACTGCAATTACTTTTTCTCTAACTTAATA 6 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-548 0.0003 ppy-mir-603 4e-34 -32.5 .........((((((.((((...(((((((((((..(((..(((((((.......)))))))..)))..)))))))))))...)))).)))))) (-32.50)