mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTAGTAAGAGTGGCAGTCGA GCTGACATATTTACTAGAGG ATAGCTGTTGTGTCACTTCCTCATGCTGACATATTTACTAGAGGGTAAAATTAATAACCTTCTAGTAAGAGTGGCAGTCGAAGGGAAGGACTCAT 3 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-628 1e-34 mml-mir-628 5e-49 -37 ........((.(((.((((((..(((((.(((.(((((((((((((..........))))))))))))).))).))).))..))))))))).)). (-37.00)