mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGAGGCAGCGCTCTCAGGAC TCTGGGCTCTGCTCCTCCTCA CAGTGCTGGGATCTCAGGAGGCAGCGCTCTCAGGACGTCTCCACCATGGTCTGGGCTCTGCTCCTCCTCACCCTCCTCACTCAGGGCACAGGTGA 4 2 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-650 1e-28 mml-mir-650a-2 1e-46 -31.61 ..(((((((((....((((((.((((..(((((..(((.......)))..)))))...)))))))))).....)))).......)))))...... (-31.61)