mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGGTTCAATGCGGGTGTTA GTTCTGTGTGTAGCTAAGGG ATGGTGAAGGCGAAGAATTGTCATGGTTCAATGCGGGTGTTAGAGTTGGTGTAGGGATTGGTCTTGGCATCTGTCTTGGAGTAGGTATAGGAGTCGGATTATTTGTTCGTACCTACCAAGCAACCACTAGAAACTTCAAAAGGCGGCTCGGGTGATCACAAATTCTCACCTTGAATACTCCCTTGTGTGTTCCCTGTAAATCCAAAAGGTAGCTAACTTCTATCTCTGTTAACTGATAGTTCTGTGTGTAGCTAAGGGTCGTTCGTCAATCCGTTG GGGATCGGCCATTACGGCCGGGGGGGTCTTGGAGAGAACAAGTAGCAACAGTTTTATTGGAGATTCTAAAAGTAATTCCAAACGATGGAACATGGATTGTAAAGCAGAGATCACAGCTGGATGTGGATTCCTAAAGGGGAAACAACTTTTGGGCTCAGAATTACAATTGCCAACTATTGAGGTATACGTTGTTGGTGTCTCTGCTGGAACACCAATCATCCTAACAAAGAGTTTGGAACTTTGTCTCCGGAAGAAGCACAACAGGAAGGGTATGTTGGATTCAATCCCAGAGTATGAGACAACAGAGCCCAGGAAAGATGTTTCCACGGAGCTTGATCTGCAGGCACATGAATACAGAAACTACAATCTGGAAAACGATGAAGAGTGCAACAAAATGTACTGGAGGAGAACAGAATACATGGATGGTGAAGGCGAAGAATTGTCATGGTTCAATGCGGGTGTTAGAGTTGGTGTAGGGATTGGTCTTGGCATCTGTCTTGGAGTAGGTATAGGAGTCGGATTATTTGTTCGTACCTACCAAGCAACCACTAGAAACTTCAAAAGGCGGCTCGGGTGATCACAAATTCTCACCTTGAATACTCCCTTGTGTGTTCCCTGTAAATCCAAAAGGTAGCTAACTTCTATCTCTGTTAACTGATAGTTCTGTGTGTAGCTAAGGGTCGTTCGTCAATCCGTTGTGCTTCGTTTTTTTTTTCTTTCATCTGTTTATATTACTTGTAATGCAGAAAATTTTGTTTTTTTTTTCCGTTTTGCGTGAGAAAATAGACAATTTAGTGGTATGTAGGAGAAATGACTATAATCATCCATCTCATGGTTATACATATCTA 4 1 5' arm Tropaeolum_majus mirnest 100 100 -61.3 ((((....((((((((....((.(((((..(((((((..(((.((((((..(((((((.((..(((((((((...(((((.....((((((.((.(((..((((((...(((((....(((..((................))..))).)))))...))))))))).))...((((((........))))))))))))..))))).)))).)))))..)).)))))))))))))..))).)))))))..))))).)).)).))))))...)))).. (-61.3)