mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATTATTGTATATCAGATGAG CATCTGATATACAATATTTTCT GTTCCAGACACATCTCATCTGATATACAATATTTTCTTAAATTGTAAAAAGAGAAATTATTGTATATCAGATGAGATGTGTCTGGGGT 1 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-944 1e-43 hsa-mir-944 4e-34 -53.9 (..((((((((((((((((((((((((((((.((((((............)))))).))))))))))))))))))))))))))))..) (-53.90)