mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAGGACTCGGGAGGTGG ACCTCCTCTCTCCTCAG GTGAGGACTCGGGAGGTGGAGGGTGGCGCCGCCGGGGCCAGGCGCTGTCTAAGCTCGCTTCTCCCCCCACCTCCTCTCTCCTCAG 4 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-1224 3e-32 ppy-mir-1224 2e-38 -44.9 .((((((...(((((((((.(((.((((((((....))..))))))....(((....)))...))))))))))))...)))))). (-44.90)