mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCCATTCTGCCTGGCCTAG GGGTGGGCAGGTGGGTGGGAAGC GTGGGTGGGCAGGTGGGTGGGAAGCCCTGGGACGCTGCCTCCTCTCTCCTGGGGCCTCTCTCGGGCTGGGGGCTGGTCTCAGTTTCCCCATTCTGCCTGGCCTAG 3 3 3' arm Macaca_mulatta mirbase 100 100 -54.3 .((((((((((((...(.(((((((..((((((.(.((((((.....(((((((....)))))))..)))))).)))))))))))))))..))))))).))))). (-54.30)