mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTGCCAGTTGAAGAACTGT AGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTA GGCTGAGCCGCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTATGTCCTGACCCAGCTAAAGCTGCCAGTTGAAGAACTGTTGCCCTCTGCC 0 2 3' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-22 7e-42 eca-mir-22 4e-43 -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).))) (-39.80)