mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGT AATCAGCAAGTATACTGCCCTA GGCCAGCTGTGAGTGTTTCTTTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTTGTGAGCAATAGTAAGGAAGCAATCAGCAAGTATACTGCCCTAGAAGTGCTACACATTGTGGGGCCT 1 2 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-34 1e-40 mml-mir-34a 6e-58 -51.8 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). (-51.80)