mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGGCAGCGGTTGATCGAT CGATAAACCTCTGCATCCAGC GAGAAAAAGGAGCGAAAGATGCTGGAGGCAGCGGTTGATCGATCTCTTTGTGGGAAATTTTGGAAAAAAAAACTCAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTCGCCACTTCATCACTC CGGCACGAGGACTCAGATTCTGGTTGACTTGTTCAAACATCATCACTCGGTTTCCTTCTTTTATGACCACTTTCTGTGTAGATTCATAGATCTTACATGAACTCCAGATCTCAGATTCCTTGTGTCCCAGTTTATCTGCAGATGCATGTGTGTTTCATAGATTTGTTCCACGTTATTATTTTTATTCTTGTCCATGTGCGTCTGTCTTGATTGATGAACCAATGAATATCTAGCATCTATTGTTATTTGTTAATAATAGTGCTTTGTTTTTGACCATTGTTTTTCAGATCTGAGATTTATTGTTTGCTCCAAATCGGGATATTTTTTTTTTTTTCATTTCATTCATTTAAAAAGTTAAATTTAATGAGTTTGTTAGAGGTTGACAAAAAAAAATGAATTTGTTAGAGAAAAAGGAGCGAAAGATGCTGGAGGCAGCGGTTGATCGATCTCTTTGTGGGAAATTTTGGAAAAAAAAACTCAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTCGCCACTTCATCACTCGTACTTTTAATCCGTTTTAAATTTTCAAAGATTACATAATCGTTCTTTTTTTTGTTATTGACTCGATCTATTGTATACGCAACAAATTGGTTTCCTAGTACTTTTGTTTGTTTGTTAATCGAGTATACGTATG 3 0 5' arm Brassica_napus mirnest MIR162_2 9e-18 ath-MIR162a 0.000000000007 -47.5 ..((..(((..((((....(((((((.((((.((((.((((((((.((((((.((..((((....))))....))....)))))).)))))))).)))).)))).))))))).))))..)))..)).... (-47.5)