mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCT TGCGCTCCTCTCAGTCCCTGAGACCCTAACTTGTGATGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCTGCGAGTCGTGCT 6 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase lin-4 1e-28 age-mir-125b-1 7e-45 -43.4 .((((..(((.(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))).)))..)))). (-43.40)