mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTTATCCGTGTTGCCTTCG AATCATACACGGTTGACCTATT GAGGTACTTGAAGATAGGTTATCCGTGTTGCCTTCGCTTTATTTGTGACGAATCATACACGGTTGACCTATTTTTCAGTACCAA 5 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-154 2e-36 mml-mir-154 2e-42 -36.8 ..((((((.((((((((((((.((((((....(((((.........).))))....)))))).)))))))))))).)))))).. (-36.80)