mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATCCCTTGCATGGTGGAGGGT CCTCCCACATGCAGGGTTTGCA TGCTCCCTCTCTCACATCCCTTGCATGGTGGAGGGTGAGCTTTATGAAAACCCCTCCCACATGCAGGGTTTGCAGGATGGTGAGCC 5 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-188 2e-39 mml-mir-188 1e-43 -39.8 .((((((..(((..((..(((((((((..((((((....(.....).....))))))..)))))))))..))..))).)).)))). (-39.80)