mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAGGAAGTGTGTGG ACATGCTTCTTTATATCCCCATA TGCTTCCCGAGGCCACATGCTTCTTTATATCCCCATATGGATTACTTTGCTATGGAATGTAAGGAAGTGTGTGGTTTCGGCAAGTG 1 1 3' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-1 2e-30 mml-mir-206 1e-43 -43.9 .((((.((((((((((((((((((((((((..(((((.(.(......).)))))).)))))))))))))))))))))))).)))). (-43.90)