mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCATCA GTGATGATGGTGGTGATGTGC AATTTTTTTGTTACCCGTGTTTCATCATCATCATCATCATCATCATCAATCCCAAGAGGGTAGATATTATGAGTGGTGGCGGTGATGATGGTGGTGATGTGCGTGGAGGTATCGGATGGG GCGTGAGGGGCTGCTAAGAGTGTGCTGTGTTGTCGATGTTGTTGTTGTTGGAAGGGAAGGAAGGAAGAGGGTGCAGGATAAAGAGCAACGGGAGGAGGAGGAGAAGGAGACCTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGGCGATGGTATTGGGGGTGCCGATGGGGGGGGATGTGGCATACGGACACGACTTTCGGAAGGCGTTTAACGCAGCCTAGCCGGGTGGTAATGGCGATGAGAAGGGGAGGGAGTGATGGAGACACGCAAGGAAGAGTCCTTGGTAGGAAGGGGAAAAGGGTTTTTGAGGGCTATAAACTAGGTATGCATATAATGCATATATGTTGTCGCAAGTTGTTCGAGTTTGGGGGTTGTGTGTGTCAATTTTTTTGTTACCCGTGTTTCATCATCATCATCATCATCATCATCAATCCCAAGAGGGTAGATATTATGAGTGGTGGCGGTGATGATGGTGGTGATGTGCGTGGAGGTATCGGATGGGCATGTGTGCCGGGGTGCGCACAGCGATACCGGGGAGAGCATCCTTCACTCGTCGCGTCGTCTTTCCCCTTGTCCTTCCCTCCCTCTCTCTTCCCCCCCCCACCGCCGTCCTCCGGTCTCTTAACATGGTTTACATTTGCGTGTTCCATGTTGT 2 0 5' arm Volvox_carteri mirnest 100 100 -39.3 ......((((.(((((((((..(((((((((((((((((((.((((((..(((....))).............)))))).))))))))))))))))))).)))))..)))).)))).... (-39.3)