mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGTTCAATGCTGGTCTAT TGACCAGCATTTTTATGGC TTGTGAGAACTTTGACCAGCATTTTTATGGCTATGGATCTGTGGAGGTGATTCTAATCAGAGGTTGGGAATATTATGGTTCAATGCTGGTCTATTATGTTTAT GATGGTATGCCTCCAAAACTTTTAATGTGCATCAGTAATTTCTACTTGGGAGGCCTTGACCATTGAGTACATTTGTGAAGAAAGTGCAATGTAAGGTTTCAACATTCTGCTACAGATTTTCAAAAATAATCTCATTTCAGTTGAGATTTTGAACTGGAGATACAAGATTTGAGGATATACAGTGTGAGGCATGGTCAGATGGATGACAGTCAGCATATTGTATATGGAGACTATTAATTCTAGCTGTGAATTTGAAGCAAAAGCTAATTTCACAGGAATAGGATATCTGTCAACATTTGTGCTTCAATACTGAGGATCAGAATCCAGGGTATATTTTGAATTCATATTTGATGACTGGGTTTTTTCCTATGTTTTTTATCAGCATTGTGGATAGTAATTTGAGCCTGAACTTCAGAAACTTTTGTGAGAACTTTGACCAGCATTTTTATGGCTATGGATCTGTGGAGGTGATTCTAATCAGAGGTTGGGAATATTATGGTTCAATGCTGGTCTATTATGTTTATTGGGGATTTTGTGCGACTTTTTATCATAGACAAATATTTGTCAAGTTTACTACTATTTACTTCAAAATAAGGCAT 4 2 3' arm Zamia_vazquezii mirnest 100 100 -26.7 ......((((...((((((((((.((((((...(((.(((((((((....)))))..))))..)))......))))))...))))))))))......)))).. (-26.7)