mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACGACGAGAGAGAGCACGC GTGTTCTCGTCCCGTTGTCAGC TACCGCGCTGTTGACGACGAGAGAGAGCACGCTTGTAGACAATAATATGATTTTGGACGGTTATTACAACGTATTTCTGTGTACATGCGTGTTCTCGTCCCGTTGTCAGCAGTAATGA AGTGCTCCGCAAAACTGTAGCGAACAACAACGGCCCTTCGATTCACCGTGTTCTCTCGTCGCTGCTAAGGCTGCGAGCTGCTGATGCTGCTAGAGCCGAAATTCTCCGAGTCACTTCGCATTCGACCGTGCAGGGTTTATGGCTGTGCAGATACCGCGCTGTTGACGACGAGAGAGAGCACGCTTGTAGACAATAATATGATTTTGGACGGTTATTACAACGTATTTCTGTGTACATGCGTGTTCTCGTCCCGTTGTCAGCAGTAATGAACAGGAGTCCAATTTTGGAGAAAGCCTCTGAAGGCAGCAACAGAGCGAGAATGCCAAAATTAATGGTCAAAATAGATATCCGCCTGCTGCTCAGAGATCGCCAAAGGCGGCGAGCTGGACTTCATTGTCTCGGGAGGTTCTACCGGCGTTGGAATATGGAAACTTGGTATGTGTTAAGTAGATACAGCGCCTGTGACAGGCACTGCAGGAACGCTGCCTATTTAAAAATAGTTGCCCATCACCAATTTATTCATCGTGAAAGAATTTTTATCCTTTCATATTCCCGATTTGATTGAATCGGTCCGTATTGATCTACAGTTTTCAAATTTTTTTTCATTTGAGTTGAGAGAGGCGTACCTTCTCCTTCCAGGGATCGACTCACCGCCGCCAAGCTGGCTCTCGTTCCTATCGAATAATTATGCTAATTATATATTTTTATATTTAATTAATACTCTTGGTCTATAAAAAAAAAAAAACTCGAGGGG 1 1 5' arm Zamia_vazquezii mirnest MIR535 0.00003 rco-MIR535 0.000001 -46.3 ......(((((((((((((.((((((((((((.((((.(((..((((((...(((...........)))))))))..))).)))).)))))))))).)).)))))))))))))..... (-46.3)