mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATCCTGCGGCTTCATT TCTATGTTGGTTTTGGGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGTGTATAGATAGTGGTACCAGATCATCCTGCGGCTTCATTCACTCAAATCACCAACAA CGGCACGAGGGTCTCTTTTCTTTCCTTTTAATGTTTTGCTCTCTCCTCCCCCTCAAAACCCAACTTCTGATAACTAAAATTTTCATTGGATAGCAATTCATATTCTCTGTATCTTCCGTAATTAATTAATAAGTTTCGAGTATATAGCTAGGGTTGATGTGAGATTTGTATATCTAGATGGATCTATTTCTATGTTGGTTTTGGGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGTGTATAGATAGTGGTACCAGATCATCCTGCGGCTTCATTCACTCAAATCACCAACAATGAACTTAAGCTTCTTAAGAAAAACGATTCCAGTCGACTTTTACGACTTCCCTGGGTTATCATTGGAGGTACCATTGACTAAGGATCAAGCCTTCTATAATATAGGTTGTGACACAAGTAACCAGTGGTTGGTATTAGATTATCTGCGTTAATCAGCACGAGAACAACTCGCCAACTCCAGCCTTTGTTTCCAAGATCTTTCATTTGGAGCTGGAGAACACATGATCGATATATGGATTGTATTAAGATCATGCATATTAATTTCCTTACTTATACTTGCATCCATTATGTCTTTTGTTCATTCGTAAGGATTTAGTGGTTTGTCGAAACAATAAGTACAACGCCCTTTTATAGTATGTTTTAGAACTTTTTACAAAATTATCTATGCAAACTGTATACTCCTTAATTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 1 5' arm Brassica_napus mirnest MIR167_1 0.000001 aly-MIR167d 0.00000000008 -43.5 ....(((((((((((((.((.(((((((((.((.((((((((.((((........)))))))))))).))))))))))).)).))))))..))))))). (-43.5)