mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATCTGGCAGTTTCAAT TTAAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAGAAGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATCTTCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGGAAGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTAATTTATTGATCTATCAATTGTTTTCCTCTATCTGAAAGTCTAACAATGATTGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTTCCCAACAGAA CTTTATGCTTCACCATCTACATTCACTATTAGCCACATCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCCGTTCTCTTTGGTTCTTAAATACATGCTTTTCTCCTCTATTATTTTTGACTTAATTTCTTACCTGCATGATTAAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAGAAGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATCTTCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGGAAGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTAATTTATTGATCTATCAATTGTTTTCCTCTATCTGAAAGTCTAACAATGATTGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTTCCCAACAGAACGACGAAAAGTCTGGCAGAATGCCTATGTGAAGAGGAAACTCAAAAAGGTATAAATGTGTTAACTCAATTCAAGAAGTCCTATTAATTGATTCT 0 1 5' arm Zingiber_officinale mirnest MIR167_1 0.0000001 sbi-MIR167c 0.000000007 -112.8 .....((((((((((...(((((((((((((((((.((((((((((.(((.((((((((((..(((((((((.(((((.((((...((.....(((((((((.........(((........)))......))))))))).....)).))))....((((((((((..........((((((...(((....((((((.(((((..((...(((((((((.((((((((...(((((........)))))..(((((..................)))))..))))))))...)))))))))...))..)).))).))))))......)))..))))))...))))))))))((.(((((((.((((.(((((.....((.......))...))))))))).))))))).)))))))...)))))))))..)))))))))).........)))...)))))))))))))))))))))))..)))).)))..))))))).. (-112.8)