mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCTGTCCCGATCCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCTGTCCCGATCCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTTCCGCGGCGAGAGCGGGTCACCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTTCTTCGGGGGCCTT CAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCTGTCCCGATCCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTTCCGCGGCGAGAGCGGGTCACCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTTCTTCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGCCAACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGCTAACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGCCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGTATAAGTGGGAGCCCTCGGGC 5 1 3' arm Zinnia_violacea mirnest 100 peu-MIR2911 4e-32 -70.1 ((((...((...)).))))..((((.((((...((((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).)))))...)))).))))..((((((....)))))).. (-70.1)