mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGCCAAGAATGGCTTGCCG AGCAGGCCTTTCTGGCTCTTC TGCTATCTATTGGCTTGCACGAAGAGATAAAGAGTGGAGCTAGAGCCAAGAATGGCTTGCCGTCGTCAATTTGCTTGCAAAAAGCAACATTTGCTCGGTAAGCTGTTGCCCAGGCCAGCAGGCCTTTCTGGCTCTTCTTTGCTCTTTGTTTTCTGATGCAAGCCTCTCCGGAG TGATCCAACACCACCACGAAGCTTAAGAGAAGACAGTCCAATTCCATCTTGTGGGCATAAAACGGAGCGAGCTTTGCTATCTATTGGCTTGCACGAAGAGATAAAGAGTGGAGCTAGAGCCAAGAATGGCTTGCCGTCGTCAATTTGCTTGCAAAAAGCAACATTTGCTCGGTAAGCTGTTGCCCAGGCCAGCAGGCCTTTCTGGCTCTTCTTTGCTCTTTGTTTTCTGATGCAAGCCTCTCCGGAG 2 1 5' arm Bruguiera_gymnorhiza mirnest 100 csi-MIR169 0.00003 -70 .....(((...((((((((...(((((((((((((((((..(((((((.(((.(((((((.(((..((((..((((((....(((((...)))))..)))))).))))....)))..))))))).)))))))))).)))))))))))).)))))..)))))))).....))). (-70)