mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACT CTCAAGAAAGCTGTGGGAAA GTCATGCTATTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTGAACTGCTTTTTATAATTTTTGTATATAGCACCATACATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGG GTCATGCTATTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTGAACTGCTTTTTATAATTTTTGTATATAGCACCATACATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGGCAATTCAGGATTTCTTCAGTTAATTGACCTTTTCTCCTTTTTCAAATCTCTTTAGTTTTCTACTTGCTTGCTCTTGTGGACAAGATCGATCCTTCTCCTGCTTCATC 1 0 5' arm Bruguiera_gymnorhiza mirnest MIR396 0.000000001 tcc-MIR396c 0.00000000008 -38 .(((((...(((((((((((((((((.(((((.((...((((...((((.......)))).)))).....)).))))).)))))))))))))))))...))))) (-38)