mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GTCATGCTATTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTGAACTGCTTTTTATAATTTTTGTATATAGCACCATACATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGGCAATTCAGGATTT GTCATGCTATTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTGAACTGCTTTTTATAATTTTTGTATATAGCACCATACATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGGCAATTCAGGATTTCTTCAGTTAATTGACCTTTTCTCCTTTTTCAAATCTCTTTAGTTTTCTACTTGCTTGCTCTTGTGGACAAGATCGATCCTTCTCCTGCTTCATC 3 0 3' arm Bruguiera_gymnorhiza mirnest MIR396 0.0000000001 tcc-MIR396c 1e-16 -41.6 ((((((...(((((((((((((((((.(((((.((...((((...((((.......)))).)))).....)).))))).)))))))))))))))))...))))))............ (-41.6)