mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCCCTGGGCCTATCCTAGAA CTAGGTATGGTCCCAGGGATCC GAGTTTGGTTTTGTTTGGGTTTGTTCTAGGTATGGTCCCAGGGATCCCAGATCAAACCAGGCCCCTGGGCCTATCCTAGAACCAACCTAAGCTC 3 1 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-331 5e-40 hsa-mir-331 2e-48 -43.52 ............(((((((((.((((((((.((((.(((((((..(.............)..))))))).)))))))))))).))))))))).. (-43.52)