mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAGAGCAATAACGAAAAATGT GTTTTTCATTATTGCTCCTGACC TGTTTTGAGCGGGGGTCAAGAGCAATAACGAAAAATGTTTGTCATAAACCGTTTTTCATTATTGCTCCTGACCTCCTCTCATTTGCTATATTCA 3 0 5' arm Homo_sapiens mirbase mir-335 1e-34 ptr-mir-335 8e-48 -41.5 .((..((((.((((((((.(((((((((.((((((((.((......)).)))))))).))))))))).)))))))).))))...))........ (-41.50)