mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCGCCTCGACGACAGAGCCG TCCCTGTCCTCCAGGAGCTCACG CGGGGCGGCCGCTCTCCCTGTCCTCCAGGAGCTCACGTGTGCCTGCCTGTGAGCGCCTCGACGACAGAGCCGGCGCCTGCCCCAGTGTCTGCGC 6 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-339 8e-45 hsa-mir-339 2e-48 -49.2 .(((((((.((((..(.(((((.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).)).))))).)..)))).))))))).(((....))) (-49.20)