mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCACACAGAAATCGCACCCGT GGGTGCTATCTGTGATTGAGGGACA GAAACTGGGCTCAAGGTGAGGGGTGCTATCTGTGATTGAGGGACATGGTTAATGGAATTGTCTCACACAGAAATCGCACCCGTCACCTTGGCCTACTTA 4 6 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-342 3e-44 mml-mir-342 2e-51 -47.7 .....(((((.((((((((.((((((..((((((.....((((((...((....))..)))))).))))))....)))))).))))))))))))).... (-47.70)